Можно ли оформить КС-2 и КС-3 на всю сумму при отгрузке продукции частями?

Добрый день.
В соответствии с договором продажа закрывается КС2 и КС3 и счетом-фактурой. Сложилась следующая ситуация: В декабре 2018 года была отгружена часть продукции, оформлена счет-фактура, в январе 2019 г еще часть продукции, оформлена счет-фактура. В настоящее время произведены окончательные работы по объекту, которые логично закрыть остатком. Однако заказчик просит подписать КС2 и КС3 на всю сумму сегодняшним числом.
Т.е. мы как подрядчики хотим закрыть предыдущие периоды промежуточными КС2 и КС3, чтобы они соответствовали счетам-фактурам. А заказчик одной окончательной, но тогда по суммам будет расхождение. Как сделать правильно, чтобы не вносить изменения в декларации в закрытых периодах и не нарушить налоговое законодательство?
Елена.